A Fundação Otorrinolaringologia apoia linhas de pesquisas através da manutenção dos Laboratórios de Investigação Médica e Habilidades Cirúrgicas, por ela totalmente equipados. Faz  investimentos diretos na infra-estrutura de pesquisas aplicadas no laboratório de documentação fotográfica e de vídeo. Mantem um laboratório de eletroacústica em suas instalações.

Abaixo as linhas de Pesquisa em desenvolvimento:

DESENVOLVIMENTO EXPERIMENTAL DE TÉCNICAS DE REABILITAÇÃO BIOMOLECULAR, ELETRÔNICA E CLINICO-CIRÚRGICA DA FUNÇÃO AUDITIVA E DO NERVO FACIAL
Prof. Dr. Ricardo Ferreira Bento
Prof. Dr. Rubens Vuono de Brito Neto
Dra. Maria Valéria Schmdt Goffi Gomez
Dra. Jeanne Oiticica Ramalho Ferraz

PESQUISA NO USO DE PRÓTESES DE ESTIMULAÇÃO NERVOSA NA REABILITAÇÃO DA SURDEZ PROFUNDA
Prof. Dr. Rubens Vuono de Brito Neto
Prof. Dr. Ricardo Ferreira Bento
Dra. Maria Valéria Schmdt Goffi Gomez

MECANISMOS FISIOPATOLÓGICOS DOS DISTÚRBIOS CÓCLEO-VESTIBULARES PERIFÉRICOS
Dra. Roseli Saraiva Moreira Bittar

CORRELAÇÃO ENTRE ALTERAÇÕES ESTRUTURAIS, FUNCIONAIS E INFLAMATÓRIAS NA FISIOPATOGÊNIA DAS RINOSSINUSITES
Prof. Dr. Richard Louis Voegels

PESQUISA NA ANATOMIA RADIOLÓGICA E ENDOSCÓPICA APLICADA À ABORDAGEM DAS CAVIDADES NASOSSINUSAIS E BASE ANTERIOR DO CRÂNIO

Prof. Dr. Richard Louis Voegels
Prof. Dr. Luiz Ubirajara Sennes

PESQUISA ANATÔMICA E EXPERIMENTAL DAS PROPRIEDADES BIOMECÂNICAS DA LARINGE
Prof. Dr. Domingos Hiroshi Tsuji
Prof. Dr. Luiz Ubirajara Sennes
Dr. Rui Imamura

IMPACTO DA OBSTRUÇÃO NASOFARINGEA NO DESENVOLVIMENTO ESTOMATOGNATICO-FACIAL E NO SONO
Profa. Dra. Renata Cantisani Di Francesco
Prof. Dr. Luiz Ubirajara Sennes

CORRELAÇÃO CLÍNICO-PATOLÓGICA DAS LESÕES IMUNOMEDIADAS DA MUCOSA ORAL
Prof. Dr. Ivan Dieb Miziara